放阳网 > 文化 > 新疆生地所解译出真盐生植物异子蓬全基因组

新疆生地所解译出真盐生植物异子蓬全基因组

发布时间:2019-11-06 07:41:44 浏览次数:2366

盐生碱蓬是一年生真正的盐生植物,主要分布在中亚,仅产于中国新疆。平叶甘薯在耐盐性、光合作用和种子性状方面具有重要的研究价值。平叶番薯可以在表层土壤含盐量超过10%的环境中正常生长,种子萌发耐盐性超过1000mol/l NaCl。杂种优势的叶、花被和果实可以在一个细胞内完成c4光合作用,这不同于典型的具有kranz结构的c4植物。此外,杂种优势可以在同一果实序列的不同位置产生棕色和黑色种子。

2019年9月,中国科学院新疆生态地理研究所研究员田常艳完成了Isodon全基因组测序和组装,并成功绘制了Isodon全基因组草图。这是世界上第一种真正的盐生植物和单细胞c4植物。组合杂种优势基因组大小为452mb,占估计杂种优势基因组大小的96.8%。共组装了4033个支架,支架n50为1.83mb,结合标记注释、同源蛋白序列注释和来自不同组织的转录组数据,获得了29604个蛋白编码基因、1651个长非编码rna和21个微rna。基因组重复率为38.41%,其中48.5%为ltr逆转录转座子。根据busco的分析,基因组完整性为89.5%。此外,构建了完整的叶绿体基因组,总长度为146654 bp。

该研究由新疆自治区重点研究开发项目、国家自然科学基金和国家重点研究开发项目资助。上述研究结果发表在“盐生植物盐生碱蓬基因组装配草案”的主题上,该计划在单个细胞内进行C4照相。



最新新闻

推荐新闻